Ich bin schon vor einer Weile über das E-Cell Projekt gestolpert. Seit 1996 arbeiten Wissenschaftler der Keio University SFC (Shonan-Fujisawa campus) an der Rekonstruktion einer ganzen Zelle in silico. Zunächst wurde ein Simulationsmodell einer hypothetischen Zelle entwickelt, die eine minimale Menge an Genen enthält. Basis hierfür war Mycoplasma genitalium, welches mit einem Genom von 580 kb schon von sich aus eine überschaubare Informationsmenge enthält. Aus den Genen von M. genitalium wurden 127 Gene ausgewählt um eine minimale Anzahl an Stoffwechselwegen zu erstellen. Die Energie bezieht die Zelle aus Glucose, welche dann u.a. zur Produktion von ATP verstoffwechselt wird.

Mittlerweile wurde eine ganze Reihe verschiedener Modelle entwickelt, wie zum Beispiel Chemotaxis, Erythrocyten, Mitochondrien und andere. Bei Gelegenheit werde ich die Software mal ausprobieren und eventuelle Ergebnisse hier posten.